Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms