Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRN4Q8WUT4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms