Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms