Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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ZNF548Q8NEK5 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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ZNF548Q8NEK5 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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ZNF548Q8NEK5 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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ZNF548Q8NEK5 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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ZNF548Q8NEK5 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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