Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms