Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG16L2Q8NAA4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms