Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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SNX20Q7Z614 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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SNX20Q7Z614 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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SNX20Q7Z614 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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SNX20Q7Z614 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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SNX20Q7Z614 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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SNX20Q7Z614 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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SNX20Q7Z614 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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SNX20Q7Z614 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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SNX20Q7Z614 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX20Q7Z614 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 654 ms