Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q71RC1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Q71RC1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q71RC1 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q71RC1 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q71RC1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q71RC1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q71RC1 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q71RC1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q71RC1 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q71RC1 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q71RC1 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q71RC1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q71RC1 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q71RC1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q71RC1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q71RC1 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q71RC1 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q71RC1 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q71RC1 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q71RC1 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q71RC1 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q71RC1 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q71RC1 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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