Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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MED27Q6P2C8 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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