Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SAMD13Q5VXD3 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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