Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms