Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CEP170Q5SW79 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms