Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHYHD1Q5SRE7 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms