Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms