Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRIM16LQ309B1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRIM16LQ309B1 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRIM16LQ309B1 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRIM16LQ309B1 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRIM16LQ309B1 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRIM16LQ309B1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms