Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
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