Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms