Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FXNQ16595 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FXNQ16595 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FXNQ16595 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FXNQ16595 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FXNQ16595 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FXNQ16595 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FXNQ16595 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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FXNQ16595 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FXNQ16595 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FXNQ16595 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FXNQ16595 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FXNQ16595 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FXNQ16595 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FXNQ16595 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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FXNQ16595 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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FXNQ16595 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FXNQ16595 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FXNQ16595 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FXNQ16595 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FXNQ16595 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FXNQ16595 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FXNQ16595 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FXNQ16595 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FXNQ16595 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FXNQ16595 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FXNQ16595 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FXNQ16595 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FXNQ16595 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FXNQ16595 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FXNQ16595 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FXNQ16595 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FXNQ16595 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FXNQ16595 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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