Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNHIT3Q15649 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms