Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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