Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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