Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
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