Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

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Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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ITGA9Q13797 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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ITGA9Q13797 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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ITGA9Q13797 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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ITGA9Q13797 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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