Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms