Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCOA4Q13772 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms