Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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