Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

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Length 666 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAMK2BQ13554 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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