Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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C1orf61Q13536 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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C1orf61Q13536 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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C1orf61Q13536 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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