Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms