Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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