Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD2Q13200 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms