Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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