Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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FOXF2Q12947 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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FOXF2Q12947 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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FOXF2Q12947 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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