Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
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PTPN13Q12923 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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