Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH17Q12864 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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