Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
STX4Q12846 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
STX4Q12846 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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STX4Q12846 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
STX4Q12846 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
STX4Q12846 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
STX4Q12846 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
STX4Q12846 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
STX4Q12846 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
STX4Q12846 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
STX4Q12846 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
STX4Q12846 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
STX4Q12846 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
STX4Q12846 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
STX4Q12846 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
STX4Q12846 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
STX4Q12846 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
STX4Q12846 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
STX4Q12846 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
STX4Q12846 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
STX4Q12846 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
STX4Q12846 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
STX4Q12846 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
STX4Q12846 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
STX4Q12846 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
STX4Q12846 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
STX4Q12846 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
STX4Q12846 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
STX4Q12846 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
STX4Q12846 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
STX4Q12846 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
STX4Q12846 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
STX4Q12846 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
STX4Q12846 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
STX4Q12846 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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