Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.8 ms