Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CD300CQ08708 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms