Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms