Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP1-1Q07627 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms