Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSME1Q06323 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms