Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEUP1Q05D60 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms