Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALD1Q05682 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms