Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms