Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP27A1Q02318 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms