Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms