Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms