Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COG7P83436 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COG7P83436 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COG7P83436 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COG7P83436 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COG7P83436 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COG7P83436 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COG7P83436 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
COG7P83436 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COG7P83436 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COG7P83436 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
COG7P83436 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COG7P83436 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COG7P83436 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COG7P83436 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COG7P83436 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
COG7P83436 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COG7P83436 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COG7P83436 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COG7P83436 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COG7P83436 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COG7P83436 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COG7P83436 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COG7P83436 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COG7P83436 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COG7P83436 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COG7P83436 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COG7P83436 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
COG7P83436 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COG7P83436 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COG7P83436 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COG7P83436 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COG7P83436 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COG7P83436 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COG7P83436 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COG7P83436 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COG7P83436 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COG7P83436 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COG7P83436 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COG7P83436 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COG7P83436 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COG7P83436 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COG7P83436 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COG7P83436 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COG7P83436 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COG7P83436 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COG7P83436 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COG7P83436 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COG7P83436 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COG7P83436 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COG7P83436 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COG7P83436 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COG7P83436 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COG7P83436 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COG7P83436 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COG7P83436 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COG7P83436 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COG7P83436 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COG7P83436 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COG7P83436 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COG7P83436 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
COG7P83436 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COG7P83436 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COG7P83436 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COG7P83436 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COG7P83436 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COG7P83436 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COG7P83436 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COG7P83436 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COG7P83436 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COG7P83436 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COG7P83436 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COG7P83436 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COG7P83436 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COG7P83436 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COG7P83436 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
COG7P83436 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COG7P83436 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COG7P83436 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COG7P83436 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COG7P83436 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COG7P83436 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COG7P83436 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COG7P83436 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COG7P83436 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COG7P83436 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COG7P83436 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COG7P83436 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COG7P83436 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
COG7P83436 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COG7P83436 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COG7P83436 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COG7P83436 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COG7P83436 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COG7P83436 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COG7P83436 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COG7P83436 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COG7P83436 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COG7P83436 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COG7P83436 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms