Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAE1P78406 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAE1P78406 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAE1P78406 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAE1P78406 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAE1P78406 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAE1P78406 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAE1P78406 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAE1P78406 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAE1P78406 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAE1P78406 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAE1P78406 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAE1P78406 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAE1P78406 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAE1P78406 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAE1P78406 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAE1P78406 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAE1P78406 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAE1P78406 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAE1P78406 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAE1P78406 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAE1P78406 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAE1P78406 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAE1P78406 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAE1P78406 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAE1P78406 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAE1P78406 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAE1P78406 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAE1P78406 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAE1P78406 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAE1P78406 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAE1P78406 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAE1P78406 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAE1P78406 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAE1P78406 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAE1P78406 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAE1P78406 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAE1P78406 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAE1P78406 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAE1P78406 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAE1P78406 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAE1P78406 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAE1P78406 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAE1P78406 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAE1P78406 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAE1P78406 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAE1P78406 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAE1P78406 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAE1P78406 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAE1P78406 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAE1P78406 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAE1P78406 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAE1P78406 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAE1P78406 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAE1P78406 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAE1P78406 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAE1P78406 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAE1P78406 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAE1P78406 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAE1P78406 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAE1P78406 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAE1P78406 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAE1P78406 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAE1P78406 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAE1P78406 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAE1P78406 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAE1P78406 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAE1P78406 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAE1P78406 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAE1P78406 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAE1P78406 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAE1P78406 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAE1P78406 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAE1P78406 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAE1P78406 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAE1P78406 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAE1P78406 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAE1P78406 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAE1P78406 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAE1P78406 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAE1P78406 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAE1P78406 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAE1P78406 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAE1P78406 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAE1P78406 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAE1P78406 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAE1P78406 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAE1P78406 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAE1P78406 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAE1P78406 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAE1P78406 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms