Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHC1P78364 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHC1P78364 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHC1P78364 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHC1P78364 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHC1P78364 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHC1P78364 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHC1P78364 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHC1P78364 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHC1P78364 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHC1P78364 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHC1P78364 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHC1P78364 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHC1P78364 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHC1P78364 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHC1P78364 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHC1P78364 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHC1P78364 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHC1P78364 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHC1P78364 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHC1P78364 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHC1P78364 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHC1P78364 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHC1P78364 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHC1P78364 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHC1P78364 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHC1P78364 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHC1P78364 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHC1P78364 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHC1P78364 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHC1P78364 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHC1P78364 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHC1P78364 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PHC1P78364 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHC1P78364 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHC1P78364 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHC1P78364 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHC1P78364 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHC1P78364 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PHC1P78364 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PHC1P78364 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHC1P78364 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHC1P78364 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHC1P78364 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHC1P78364 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHC1P78364 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHC1P78364 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHC1P78364 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHC1P78364 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHC1P78364 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHC1P78364 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHC1P78364 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHC1P78364 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHC1P78364 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHC1P78364 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHC1P78364 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHC1P78364 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHC1P78364 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHC1P78364 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHC1P78364 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHC1P78364 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHC1P78364 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHC1P78364 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHC1P78364 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHC1P78364 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHC1P78364 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHC1P78364 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHC1P78364 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHC1P78364 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHC1P78364 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHC1P78364 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHC1P78364 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHC1P78364 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PHC1P78364 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHC1P78364 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHC1P78364 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHC1P78364 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHC1P78364 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHC1P78364 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHC1P78364 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHC1P78364 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHC1P78364 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHC1P78364 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHC1P78364 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PHC1P78364 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHC1P78364 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHC1P78364 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHC1P78364 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHC1P78364 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PHC1P78364 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHC1P78364 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHC1P78364 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHC1P78364 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHC1P78364 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHC1P78364 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHC1P78364 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHC1P78364 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHC1P78364 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHC1P78364 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHC1P78364 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms